台灣位於菲律賓海板塊與歐亞板塊的碰撞造山帶，因碰撞擠壓地震特別多，岩層也不斷的破碎中。當豐沛的雨水降到地面後，就沿著裂隙或破碎的岩層滲入地下，被高的地溫梯度或岩漿的餘溫加熱，產生豐富的地熱資源（溫泉），依據過去官方、學術界和民間的探勘和研究報告顯示，台灣地區的溫泉最少有128處以上。

　　根據水利署「96年溫泉資源效能提昇技術研究」報告書中指出，溫泉資源於國外的應用上，除了具有觀光休閒遊憩之用途外，主要是以醫療保健、地熱能源利用或農漁業應用等功能為主。日本的溫泉文化歷史悠久，除了娛樂觀光外，對於溫泉帶來的健康療養已有相當多的研究根據來推廣其效用；在俄羅斯建造五間溫泉醫療中心，以溫泉來對病人進行復健治療，另外還有在地熱利用方面也是相當普遍來運用；在韓國，溫泉除了主要的觀光娛樂之用途外，還標榜著具有健康治療的效用；在美國，溫泉主要是用來作為地熱來運用，用於發電、農業、溫室加熱或融雪的應用上；法國將溫泉開發出品牌的化妝品，是個別具特色的溫泉關聯用途。相對地，目前台灣的溫泉產業經營範圍僅限於泡溫泉、住宿與餐飲，而且多數屬於個人經營，對於整體的設計規劃及服務品質沒有企業化經營的概念，且現有的技術方面也有需要克服之處。

　　有鑑於今日的台灣溫泉休閒型態太過狹隘，溫泉文化層次只停留在遊憩浸泡的初淺層次，缺少溫泉資源相關知識的深度與廣度，不如德、日兩國的溫泉保養地的發展已達到休養、保養與療養的知識經濟層級。爰此，嘉南藥理科技大學本著「厚生利民」之教育宗旨，以及「環境永續經營」的發展理念，透過教學研究單位將資源與技術類領域與規劃與管理領域整合，促成不同領域間的專家學者交流合作，特於九十六年八月奉教育部核准成立，於「環境學院」之下規劃成立『溫泉產業研究所』，並自九十七年度配合院名稱的更名，而改隸屬於「環境永續學院」。歷任所長為余光昌教授(96~98)、陳冠位副教授(98~100)、張翊峰教授(100~，現任)。

　　依據社會脈動及國家發展需求，並配合本校發展目標，落實教學品質精緻化、輔導服務適性化、研究發展實用化、推廣教育社會化、建教合作多元化、行政作業e路化之校務發展計畫精神作為本所發展之教育指導方針。本所發展策略在培養學生成為溫泉相關產業之專業經理人才，並訂定「溫泉技術研發」和「溫泉產業經營管理」作為人才培育之具體教育目標，契合台灣溫泉產業國際化所需求之專業人才，展望未來台灣溫泉產業預估產值不斷增高的趨勢，本所學生未來將是台灣溫泉產業國際化和產業多元發展的研發與經營管理人才，就業榮景可期。